הפרס הלאומי לחדשנות נועד לעודד ולקדם תרבות של חדשנות, יצירתיות ושיפור מתמיד במגזרים השונים במשק – בתעשייה, במגזר הציבורי, בהייטק, בחינוך, בשירותים ובמערכת הבריאות. מטרת התחרות היא להוקיר יוזמות פורצות דרך, המעוררות השראה ותורמות לשיפור תהליכים, מוצרים, שירותים או תפוקות, תוך יצירת ערך מוסף ממשי לארגון ולחברה כולה.